Wikiversity

Inhibitor serpin peptidase inhibitor, C (antitrombin), član 1
	; Monomer antitrombina, prikaz baziran na 2ANT.
Dostupne strukture
	1ANT, 1ATH, 1AZX, 1BR8, 1DZG, 1DZH, 1E03, 1E04, 1E05, 1JVQ, 1LK6, 1NQ9, 1OYH, 1R1L, 1SR5, 1T1F, 1TB6, 2ANT, 2B4X, 2B5T, 2BEH, 2GD4, 2HIJ, 2ZNH, 3EVJ, 3KCG
Identifikatori
Simboli	SERPINC1; AT3; AT3D; ATIII; THPH7
Vanjski ID	OMIM: 107300 MGI: 88095 HomoloGene: 20139 GeneCards: SERPINC1 Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• proteazno vezivanje; • inhibitor aktivnost serinskog tipa endopeptidaze; • proteinsko vezivanje; • vezivanje heparina; • aktivnost peptidasnog inhibitora;
Celularna komponenta	• ekstracelularni region; • ekstracelularni prostor; • ćelijska membrana;
Biološki proces	• respons na nutrijent; • koagulacija krvi; • negativna regulacija aktivnosti endopeptidaze; • regulacija proteolize; • negativna regulacija inflamatornog responsa;
Pregled RNK izražavanja
	podaci
Ortolozi

Antitrombin (AT) je mali proteinski molekul koji inaktivira nekoliko enzima koagulacionog sistem. Antitrombin je glikoprotein koji formira jetra i sastoji se od 432 aminokiselina. On sadrži tri disulfidne veze i četiri moguća mesta glikozilacije. α-Antitrombin je dominantna forma antitrombina nađena u krvnoj plazmi i sadrži oligosaharid u sva četiri mesta glikozilacije. Jedno mesto glikozilacije je konzistentno nezauzeto u drugoj formi antitrombina, β-antitrombinu.^[1] Njegova aktivnost se višestruko povećava antikoagulantskim lekom heparinom, koji pojačava vezivanje antitrombina za faktor II i faktor X.

Nomenklatura antitrombina

Antitrombin se takođe naziva antitrombin III (AT III). Oznake antithrombin I do antitrombina IV potiču i ranijih studija tokom 1950-tih.^[2]

Antitrombin I (AT I) se odnosi na apsorpciju trombina u fibrin nakon aktivacije trombina fibrinogenom. Antitrombin II (AT II) se odnosi na kofaktor u plazmi, koji zajedno sa heparinom ometa interakciju trombina i fibrinogena. Antitrombin III (AT III) se odnosi na supstancu u plazmi koja inaktivira trombin. Antitrombin IV (AT IV) se odnosi na antitrombin koji postaje aktiviran tokom i kratkotrajno nakon koagulacije krvi.^[3] AT III a posebno AT I su medicinski značajni. AT III se generalno odnosi samo na "antitrombin".

Struktura

Antitrombin ima poluživot u krvnoj plazmi od oko jednog dana.^[4] Normalna antitrombinska koncentracija u ljudskoj krvnoj plazmi je visoka, oko 0.12 mg/ml, što je ekvivalentno sa molarnom koncentracijom od 2.3 μM.^[5]

Antitrombin je izolovan iz plazme velikog broja vrsta.^[6] Iz rezultata proteinskog i kDNK sekvenciranja, goveđeg, ovčijeg, zečijeg i mišjeg antitrombina sledi da su oni 433 aminokiseline dugi, što je za jednu aminokiselinu duže od ljudskog antitrombina. Dodatna aminokiselina se javlja u poziciji 6. Antitrombini govečeta, ovce, zeca, moša, i čoveka imaju 84 - 89% identične aminokiseline.^[7] Šest aminokiselina formira tri intramolekularna disulfidna mosta, Cys8-Cys128, Cys21-Cys95, i Cys248-Cys430. Svi oni imaju četiri potencijalna mesta N-glikozilacije. Do nje dolazi na asparaginskim (Asn) aminokiselinama sa brojevima 96, 135, 155, i 192 kod ljudi i na sličnim pozicijama kod drugih vrsta. Sva ta mesta su zauzeta kovalentno vezanim oligosaharidnim bočnim lancima u predominantnoj formi ljudskog antitrombina, α-antitrombinu, tako da je molekulska težina ove forme antitrombina 58,200.^[1] Potencijalno mesto glikozilacije asparagina 135 nije zauzeto u maje prisutnom obliku (oko 10%) antitrombina, β-antitrombinu.^[8]

Rekombinantni antitrombini osobina sličnih normalnom ljudskom antitrombinu su bili proizvedeni koristeći insektne ćelije inficirane bakulovirusom i ćelije sisara gajene u ćelijskoj kulturi.^[9]^[10]^[11]^[12] Ti rekombinantni antitrombini generalno imaju različite obrasce glikozilacije u odnosu na normalni antitrombin, i tipično se koriste u strukturnim studijama antitrombina. Mnoštvo antitrombinskih struktura je javno dostupno.

Reference

↑ ^1,0 ^1,1 Bjork, I; Olson, JE (1997). Antithrombin, A bloody important serpin (in Chemistry and Biology of Serpins). Plenum Press. str. 17–33. ISBN 0-306-45698-2.
↑ Seegers WH, Johnson JF, Fell C. (1954). „An antithrombin reaction to prothrombin activation”. Am. J. Physiol. 176 (1): 97–103. PMID 13124503.
↑ Yin ET, Wessler S. and Stoll PJ. (1971). „Identity of plasma-activated factor X inhibitor with antithrombin 3 and heparin cofactor”. J. Biol. Chem. 246 (11): 3712–3719. PMID 4102937.
↑ Collen DJ, Schetz F. et al. (1977). „Metabolism of antithrombin III (heparin cofactor) in man: Effects of venous thrombosis of heparin administration”. Eur. J. Clin. Invest 7 (1): 27–35. DOI:10.1111/j.1365-2362.1977.tb01566.x. PMID 65284.
↑ Conrad J, Brosstad M. et al. (1983). „Molar antithrombin concentration in normal human plasma”. Haemostasis 13 (6): 363–368. PMID 6667903.
↑ Jordan RE. (1983). „Antithrombin in vertebrate species: Conservation of the heparin-dependent anticoagulant mechanism”. Arch. Biochem. Biophys 227 (2): 587–595. DOI:10.1016/0003-9861(83)90488-5. PMID 6607710.
↑ Olson ST, Bjork I. (1994). „Regulation of thrombin activity by antithrombin and heparin”. Sem. Thromb. Hemost. 20 (4): 373–409. DOI:10.1055/s-2007-1001928. PMID 7899869.
↑ Brennan SO, George PM, Jordan, RE. (1987). „Physiological variant of antithrombin-III lacks carbohydrate side-chain at Asn 135”. FEBS Lett 219 (2): 431–436. DOI:10.1016/0014-5793(87)80266-1. PMID 3609301.
↑ Stephens AW, Siddiqui A. and Hirs CH. (1987). „Expression of functionally active human antithrombin III”. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84 (11): 3886–3890. DOI:10.1073/pnas.84.11.3886. PMC 304981. PMID 3473488.
↑ Zettlmeissl G, Conradt HS. et al. (1989). „Characterization of recombinant human antithrombin III synthesized in Chinese hamster ovary cells”. J. Biol. Chem. 264 (35): 21153–21159. PMID 2592368.
↑ Gillespie LS, Hillesland KK and Knauer DJ. (1991). „Expression of biologically active human antithrombin III by recombinant baculovirus in Spodoptera frugiperda cells”. J. Biol. Chem. 266 (6): 3995–4001. PMID 1995647.
↑ Ersdal-Badju E, Lu A. et al. (1995). „Elimination of glycosylation heterogeneity affecting heparin affinity of recombinant human antithrombin III by expression of a beta-like variant in baculovirus-infected insect cells”. Biochem. J. 310: 323–330. PMC 1135891. PMID 7646463.

Literatura

Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0.
Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X.
Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842.

Bjork, I; Olson, JE (1997). Antithrombin, A bloody important serpin (in Chemistry and Biology of Serpins). Plenum Press. str. 17–33. ISBN 0-306-45698-2.
Panzer-Heinig, Sabine (2009). Antithrombin (III) - Establishing Pediatric Reference Values, Relevance for DIC 1992 versus 2007. Medizinische Fakultät Charité - Universitätsmedizin Berlin.

Vanjske veze

I04.018 MEROPS Arhivirano 2019-10-16 na Wayback Machine-u
MeSH Antithrombin+III

[bjork-1] 1,0 ^1,1 Bjork, I; Olson, JE (1997). Antithrombin, A bloody important serpin (in Chemistry and Biology of Serpins). Plenum Press. str. 17–33. ISBN 0-306-45698-2.

[2] Seegers WH, Johnson JF, Fell C. (1954). „An antithrombin reaction to prothrombin activation”. Am. J. Physiol. 176 (1): 97–103. PMID 13124503.

[3] Yin ET, Wessler S. and Stoll PJ. (1971). „Identity of plasma-activated factor X inhibitor with antithrombin 3 and heparin cofactor”. J. Biol. Chem. 246 (11): 3712–3719. PMID 4102937.

[4] Collen DJ, Schetz F. et al. (1977). „Metabolism of antithrombin III (heparin cofactor) in man: Effects of venous thrombosis of heparin administration”. Eur. J. Clin. Invest 7 (1): 27–35. DOI:10.1111/j.1365-2362.1977.tb01566.x. PMID 65284.

[5] Conrad J, Brosstad M. et al. (1983). „Molar antithrombin concentration in normal human plasma”. Haemostasis 13 (6): 363–368. PMID 6667903.

[6] Jordan RE. (1983). „Antithrombin in vertebrate species: Conservation of the heparin-dependent anticoagulant mechanism”. Arch. Biochem. Biophys 227 (2): 587–595. DOI:10.1016/0003-9861(83)90488-5. PMID 6607710.

[olson-7] Olson ST, Bjork I. (1994). „Regulation of thrombin activity by antithrombin and heparin”. Sem. Thromb. Hemost. 20 (4): 373–409. DOI:10.1055/s-2007-1001928. PMID 7899869.

[8] Brennan SO, George PM, Jordan, RE. (1987). „Physiological variant of antithrombin-III lacks carbohydrate side-chain at Asn 135”. FEBS Lett 219 (2): 431–436. DOI:10.1016/0014-5793(87)80266-1. PMID 3609301.

[9] Stephens AW, Siddiqui A. and Hirs CH. (1987). „Expression of functionally active human antithrombin III”. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84 (11): 3886–3890. DOI:10.1073/pnas.84.11.3886. PMC 304981. PMID 3473488.

[10] Zettlmeissl G, Conradt HS. et al. (1989). „Characterization of recombinant human antithrombin III synthesized in Chinese hamster ovary cells”. J. Biol. Chem. 264 (35): 21153–21159. PMID 2592368.

[11] Gillespie LS, Hillesland KK and Knauer DJ. (1991). „Expression of biologically active human antithrombin III by recombinant baculovirus in Spodoptera frugiperda cells”. J. Biol. Chem. 266 (6): 3995–4001. PMID 1995647.

[12] Ersdal-Badju E, Lu A. et al. (1995). „Elimination of glycosylation heterogeneity affecting heparin affinity of recombinant human antithrombin III by expression of a beta-like variant in baculovirus-infected insect cells”. Biochem. J. 310: 323–330. PMC 1135891. PMID 7646463.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]