LIMSwiki

در ژنتیک، یک زیرشاخه (به انگلیسی: subclade) زیرگروهی از یک هاپلوگروپ است.[۱]

قرارداد نامگذاری

اگرچه هاپلوگروه ها و زیرشاخه های دی ان ایه میتوکندری انسان (mtDNA) و دی ان ایه کروموزوم Y (Y-DNA) به روشی مشابه نامگذاری شده اند، نام آنها متعلق به سیستم های کاملاً جداگانه است. [۲]

دی ان ایه میتوکندری

هاپلوگروه‌های دی ان ایه میتوکندری (mtDNA) با حضور یک سری از نشانگرهای پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP) در نواحی بیش‌متغیر و ناحیه کدکننده DNA میتوکندری تعریف می‌شوند. آنها با حروف بزرگ A تا Z نامگذاری می شوند و زیرشاخه های دیگر با استفاده از اعداد و حروف کوچک نامگذاری می شوند. [۲]

دی ان ایه کروموزوم Y

هاپلوگروه های Y-DNA با حضور یک سری نشانگر SNP در کروموزوم Y تعریف می شوند. زیرکلیدها توسط یک SNP انتهایی تعریف می‌شوند، SNP در انتهای درخت فیلوژنتیک کروموزوم Y قرار دارد. [۳]

Y-DNA انسان

کنسرسیوم کروموزوم Y (YCC) سیستمی برای نام‌گذاری هاپلوگروپ‌های اصلی Y-DNA انسانی با حروف بزرگ A تا T ایجاد کرد که زیرشاخه‌های دیگر با استفاده از اعداد و حروف کوچک نام‌گذاری شدند ( نام‌گذاری YCC longhand). نامگذاری مختصر YCC، هاپلوگروه های Y-DNA و زیرشاخه های آنها را با حرف اول هاپلوگروپ اصلی Y-DNA به همراه یک خط تیره و نام SNP پایانه تعیین کننده نام می برد. [۴] نامگذاری هاپلوگروپ Y-DNA در طول زمان در حال تغییر است تا با تعداد فزاینده SNP های کشف و آزمایش شده، و در نتیجه گسترش درخت فیلوژنتیک کروموزوم Y سازگار شود. این تغییر در نامگذاری منجر به استفاده از نامگذاری متناقض در منابع مختلف شده است. [۵] این ناهماهنگی، و نامگذاری دست و پا گیر فزاینده دراز، باعث حرکت به سمت استفاده از نامگذاری ساده تر شده است.

همچنین ببینید

مراجع

  1. Etruria and the Origins of the Etruscans. Caselli, Giovanni. Cambridge Scholars Publishing. ۲۰۲۲-۰۷-۲۱. ص. ۳۳. شابک ۹۷۸-۱-۵۲۷۵-۸۴۷۵-۴.
  2. ۲٫۰ ۲٫۱ "Understanding Results: mtDNA: How are mitochondrial DNA (mtDNA) Haplogroups named?". Family Tree DNA. Retrieved 3 April 2013. خطای یادکرد: برچسب <ref> نامعتبر؛ نام «mtDNAnames» چندین بار با محتوای متفاوت تعریف شده است. (صفحهٔ راهنما را مطالعه کنید.).
  3. "myFTDNA 2.0 User Guide: Y-DNA: What is the Y-DNA - Matches page?". Family Tree DNA. Retrieved 31 March 2013. A terminal SNP determines the terminal (final) subbranch on the Y-DNA Tree to which someone belongs.
  4. "Understanding Results: Y-DNA Single Nucleotide Polymorphism (SNP): How are haplogroups and their subclades named?". Family Tree DNA. Retrieved 31 March 2013.
  5. "Understanding Haplogroups: How are the haplogroups named?". Family Tree DNA. Archived from the original on 21 June 2012. Retrieved 31 March 2013.