Knowledge Base Wiki

EF hand
Strukctura rekombinantnog Paramecium tetraurelia kalmodulina.[1]
Identifikatori
Simbol	efhand
Pfam	PF00036
InterPro	IPR002048
PROSITE	PDOC00018
SCOP	1osa
SUPERFAMILY	1osa
OPM protein	1djx
Dostupne proteinske strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum structure summary

EF ruka je heliks-zavoj-heliks strukturni domen prisutan u velikom broju familija proteina koji vezuju kalcijum. Motiv EF ruke sadrži heliks-zavoj-heliks topologiju, slično raširenom palcu i kažiprstu ljudske ruke, u kome su Ca²⁺ joni koordinirani sa ligandima unutar petlje. On se sastoji od dva alfa heliksa pozicionirana otprilike normalno jedan na drugi i povezana kratkom petljom (često 12 aminokiselina dugom) koja obično vezuje jone kalcijuma. Ime ovog motifa potiče iz tradicionalne nomenklature koja se koristi za opisivanje proteina parvalbumina, koji sadrži tri takva motiva, i koji verovatno učestvuje u relaksaciji mišića putem svog vezivanja kalcijuma. Motivi EF ruke se takođe javljaju u svakom strukturnom domenu signalnog proteina kalmodulina i u mišićnom proteinu troponin-C.

Ljudski proteini koji sadrže ovaj domena su:

• Eukaryotic Linear Motif resource motif class .html LIG_IQ
• Nelson M, Chazin W. „EF-Hand Calcium-Binding Proteins Data Library”. Vanderbilt University. Архивирано из оригинала 25. 08. 2009. г. Приступљено 29. 8. 2009. 
• Haiech J. „EF-hand protein database (EF-handome)”. European Calcium Society and the Université Libre de Bruxelles. Архивирано из оригинала 09. 08. 2009. г. Приступљено 29. 8. 2009. „upon request to haiech@pharma.u-strasbg.fr” 
• Yang J. „Calciomics”. Georgia State University. Приступљено 29. 8. 2009. „prediction server for EF-hand calcium binding proteins”