Knowledge Base Wiki

Search for LIMS content across all our Wiki Knowledge Bases.

Type a search term to find related articles by LIMS subject matter experts gathered from the most trusted and dynamic collaboration tools in the laboratory informatics industry.

NOSIP
Identifikatori
AliasiNOSIP, CGI-25, protein u interakciji s dušik-monoksid sintazom
Vanjski ID-jeviOMIM: 616759 MGI: 1913644 HomoloGene: 9315 GeneCards: NOSIP
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za NOSIP
Genomska lokacija za NOSIP
Bend19q13.33Početak49,555,468 bp[1]
Kraj49,590,262 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za NOSIP
Genomska lokacija za NOSIP
Bend7|7 B3Početak44,711,853 bp[2]
Kraj44,727,634 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
aktivnost sa transferazom
vezivanje sa RNK
GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Ćelijska komponenta citoplazma
citosol
Golđijeva membrana
jedro
Biološki proces GO:0048553 negative regulation of catalytic activity
negative regulation of nitric-oxide synthase activity
multicellular organism development
protein ubiquitination
regulation of nitric-oxide synthase activity
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001270960
NM_015953
NM_001363649

NM_001163684
NM_025533

RefSeq (bjelančevina)

NP_001257889
NP_057037
NP_001350578

NP_001157156
NP_079809

Lokacija (UCSC)Chr 19: 49.56 – 49.59 MbChr 7: 44.71 – 44.73 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein u interakciji s dušik-monoksid sintazom je enzim koji je kod ljudi kodiran genom NOSIP.[5][6][7]

Kloniranje i ekspresija

Korištenjem domena oksigenaze ljudskog ENOS (NOS3) kao mamca na 2-hibridnom ekranu kvasca u biblootetici posteljične cDNK, Dedio et al. (2001) klonirali su NOSIP. Izvedeni protein od 301 aminokiseline ima izračunatu molekulskuu masu od 34 kD. NOSIP dijeli 46% i 29% aminokiselinskih identiteta sa ortolozima C. elegans i A. thaliana. Northern blot analizom otkriven je 1,2 kb NOSIP-ov transkript koji je bio izrazito eksprimiran u ljudskom srcu i mozgu, s nižim nivoima u plućima i skeletnim mišićima. U bubrezima, jetri, gušterači i slezeni nije otkrivena bilo kakva ekspresija. Imunohistokemijska analiza pacovskovg srca otkrila je obilnu ekspresiju Nosipa u endotelnim ćelijama srčane mikrovaskulature. Western blot analiza ljudskih vaskulsdkih endotelnih ćelija pokazala je NOSIP pri prividnoj molekulskoj masi od 34 kD.

Aminokiselinska sekvenca

Simboli
1020304050
MTRHGKNCTAGAVYTYHEKKKDTAASGYGTQNIRLSRDAVKDFDCCCLSL
QPCHDPVVTPDGYLYEREAILEYILHQKKEIARQMKAYEKQRGTRREEQK
ELQRAASQDHVRGFLEKESAIVSRPLNPFTAKALSGTSPDDVQPGPSVGP
PSKDKDKVLPSFWIPSLTPEAKATKLEKPSRTVTCPMSGKPLRMSDLTPV
HFTPLDSSVDRVGLITRSERYVCAVTRDSLSNATPCAVLRPSGAVVTLEC
VEKLIRKDMVDPVTGDKLTDRDIIVLQRGGTGFAGSGVKLQAEKSRPVMQ
A

Funkcija gena

Koristeći uzajamnu koimunoprecipitaciju i Western blot analizu, Dedio i et al. (2001) potvrdili su interakciju između ENOS i NOSIP u kotransficiranim COS-7 ćelijama. Delecijska analiza pokazala je da je NOSIP vezao C-terminalni dio domena ENOS-oksigenaze u regiji koja se preklapala sa mjestom vezanja za kaveolin plazmamembrane. Prekomerna ekspresija NOSIP-a smanjila je proizvodnju dušik-oksida stimuliranu kalcijem u ćelijama jajnika kineskog hrčka (CHO) koje eksprimiraju ENOS. Prekomerna ekspresija NOSIP-a također je smanjila lokalizaciju ENOS-a u membrani ćelija CHO, uzrokujući prelazak sa frakcija membrane bogatih kaveolinom u unutarćelijske odjeljke. Dedio et al. (2001) zaključili su da NOSIP promovira translokaciju ENOS-a iz plazemamembrane na unutarćelijska mjesta, čime inhibira sintezu dušik-oksida. Koristeći afinitetnu hromatografiju i masenu spektrometrijsku analizu, Hoffmeister et al. (2014) otkrili su da je Nosip miš stupio u interakciju sa kompleksom proteinske fosfataze-2A (PP2A) koji sadrži katalitske podjedinice Pp2aca (PPP2CA) i Pp2acb (PPP2CB), podjedinicu skele Pr65-alfa (PPP2R1A) i regulatornu podjedinicu Pr55-alfa (PPP2R2B). Eksperimenti s povlačenjem proteina potvrdili su da je Nosip taložio holoenzim PP2A. Analiza ubikvitinacije in vitro pokazala je da je Nosip djelovao kao E3 ubikvitin-ligaza u monoubikvitinaciji katalitske podjedinice PP2A. Monoubikvitinacija nije uzrokovala proteasomsku degradaciju PP2A, ali izgleda da je smanjila aktivnost PP2A, putem nerazgradivog mehanizma.

Životinjski model

Koristeći carski rez, Hoffmeister et al. (2014) dobili su mišje embrione Day-18,5 Nosip –/– u mendelovskom omjeru, ali svi su umrli nedugo nakon rođenja, sa znakovima respiratornog distresa i cijanoza, vjerovatno zbog poteškoća s disanjem uzrokovanih ozbiljnim kraniofacijalnim malformacijama. Malformacije u miševa Nosip –/– kretale su se od očnog hipotelorizma, uske njuške, bočnog rascjepa usne i rascjepa sekundarnog nepca, do ciklopije i prisustva proboscisa ili pojedinačne izbočine nalik glavi bez likova lica. Analiza morfologije prednjeg mozga kod miševa Nosip –/– pokazala je karakteristična obilježja holoprosencefalije. Hoffmeister et al. (2014) otkrili su da je nedostatak Nosipa u tkivima Nosip –/– - nepca i lica, ali ne i u neoštećenom tkivu Nosip –/– pluća, povezan s povećanom aktivnošću PP2A.[8][9]

Reference

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000142546 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000003421 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Dedio J, Konig P, Wohlfart P, Schroeder C, Kummer W, Muller-Esterl W (Jan 2001). "NOSIP, a novel modulator of endothelial nitric oxide synthase activity". FASEB J. 15 (1): 79–89. doi:10.1096/fj.00-0078com. PMID 11149895. S2CID 34485514.
  6. ^ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (Aug 2000). "Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics". Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10.1101/gr.10.5.703. PMC 310876. PMID 10810093.
  7. ^ "Entrez Gene: NOSIP nitric oxide synthase interacting protein".
  8. ^ Dedio, J., Konig, P., Wohlfart, P., Schroeder, C., Kummer, W., Muller-Esterl, W. NOSIP, a novel modulator of endothelial nitric oxide synthase activity. FASEB J. 15: 79-89, 2001. [PubMed]: 11149895
  9. ^ Hoffmeister, M., Prelle, C., Kuchler, P., Kovacevic, I., Moser, M., Muller-Esterl, W., Oess, S. The ubiquitin E3 ligase NOSIP modulates protein phosphatase 2A activity in craniofacial development. PLoS One 9: e116150, 2014. Note: Electronic Article. [PubMed]: 25546391

Dopunska literatura